Всем привет!

Подскажите какой-нибудь удобный способ разделения программно установленного отбора от отбора, установленного пользователем.

КомпоновщикНастроек.Настройки.Отбор

если его кинуть на форму -то у этого табличного поля есть обработчики события

А с какой целью?
Тебе случаем не "ФиксированныеНастройки" нужны?

(2) Просто есть сложные отборы, которые устанавливаются в зависимости от опций(галок). И нужно еще чтоб пользователь свои отборы мог установить.

(0) 8.1 или 8.2?

(4) 8.1

(1) Но туда же нельзя реквизит добавить?

(3) Так реализуй "сложные галочные" отборы еще на уровне запроса. Чтобы в настройках они инициировались просто булевым параметром.

В 8.2 можно было бы именные отборы любой сложности забабахать... В 8.1 вроде еще нет групп условий.

(5) Тогда или как в (7), или предварительно сохранять настройки программные и пользовательские в разные переменные. Потом после вывода отчёта откатывать настройки до нужного состояния.

(7) + Вернее, не галочным параметром, а булевым полем результата запроса.
Например, нужно фильтровать по галке "Великий и могучий, но тупой". Формируешь булево поле в запросе КАК ВеликийИМогучийНоТупой (через ВЫБОР). Тогда отбор в СКД у тебя будет выглядеть просто как "Великий и могучий, но тупой" = Истина. И будет без разницы как его устанавливать. И необходимости отделять от пользовательских отборов тоже не будет.