Запрос = Новый Запрос;
   Запрос.Текст =
   "ВЫБРАТЬ
   |    Пользователи.Ссылка КАК Пользователь
   |ИЗ
   |    Справочник.Пользователи КАК Пользователи
   |ГДЕ
   |    Пользователи.ПометкаУдаления = ЛОЖЬ
   |    И Пользователи.ЭтоГруппа = ЛОЖЬ
   |ИТОГИ ПО
   |    Пользователь ИЕРАРХИЯ";
   
   ЭлементыФормы.Пользователи.Значение = Запрос.Выполнить().Выгрузить(ОбходРезультатаЗапроса.ПоГруппировкамСИерархией);
   
   ЭлементыФормы.Пользователи.СоздатьКолонки();

Дублируются данные:

т.е.

Иванов АА
--Иванов АА
Сидоров АА
--Сидоров АА

что не так?

ТОЛЬКО ИЕРАРХИЯ

бесовско как то...
надо    |    НЕ (Пользователи.ПометкаУдаления
       |    И Пользователи.ЭтоГруппа)

(2) это уже другое условие

(1) да сделал ТОЛЬКО ИЕРАРХИЯ все бы хорошо НО для тех элементов справочника, которые находятся в корне в дереве значений выводится сначала пустая строка а потом элементы:

(ПУСТО)
--Иванов
--Петров

(2) да ладно )

(1) и еще
если в справочнике есть папка Табельщики, в ней заполнены элемены, также в этой папке есть еще одна папочка Прочие табельщики, то выводится следующее:

Табельщьки
--Прочие Табельщик
----Иванов
--Табельщики
----Петров
----Сидоров

НЕКРАСИВО!

хотелось бы получить что то наподобие:

Васильчук
Мировнов
Ананьев
Табельщики
--Прочие Табельщики
----Иванов
--Петров
--Сидоров

(4) Ну а вы как хотели? Все логично. Остальное реализуется процедурой обхода дерева и построением дерева в том виде, как надо.

(7) допустим в (5) Петров и Сидоров в Дереве находятся на 2-м уровне, а должны находится на первом уровне. Удалять строки уровней?

(8) нет, просто нужно обходить самому результат запроса и заполнять дерево

может кто то уже сталкивался с преобразованием иерархзического справочника в дерево?

(9) неужели нет универсального механизма

Запрос.Текст =
   "ВЫБРАТЬ
   |    Пользователи.Ссылка КАК Пользователь
   |ИЗ
   |    Справочник.Пользователи КАК Пользователи
   |УПОРЯДОЧИТЬ ПО
   |    Пользователь ИЕРАРХИЯ";

(12) ну тоже самое что и в (0)

(12) как обойти дерево, чтоб по человечески получилось как в (6)

(12) ИЗВИНЯЮСЬ! НЕ УВИДЕЛ УПОРЯДОЧИТЬ!

все верно работает
спасибо!