сама служба появляется в процессах mmc.exe  а окно виндовое не открывается

mmc.exe - это консоль, а не службу сервера 1с

чего-чего? кто куда не запускается?

опечатался, консоль не запускается

регистрировал ее?

не понял

перезапустил службу агента 1с, не помогло

в прямом.. зарегистрировал ли утилиту?

так всё нормально было, потом связь пропала и теперь не открывается консоль

перезагружать сервер особо не хочется

ну рубани процесс mmc.exe, и попробуй заново

(6) не на том сервере просто крутилась эта служба, нашёл нужный сервер, перезапустил и всё нормально стало