Надо загрузить справочник из другой базы, но не регистрировать изменения загруженых элементов в планах обмена
как?

можешь потом через регистрацию изменений для обмена регистрацию снять.

ПланыОбмена.УдалитьРегистрациюИзменений(УзелОбмена, ываываываыва);

После загрузки данных пройтись по списку загруженных объектов и удалить регистрацию изменений
ПланыОбмена.УдалитьРегистрациюИзменений(УзелОбмена, Ссылка);

(2) не пойдет - слишком сложно
нашел такое

(3) допустим объект был изменен не в процессе обмена, а до этого пользователем интерактивно?

http://aitika.ru/otvety/2386-1c-Kak-zapisat-obekt-chtobi-on-ne-popal-v-plani-obmena?p=2

(6) всё-таки в (2) одна строчка, а ты нам какую-то фигню на целую страницу привел.

(7) Объект.ОбменДанными.Получатели.Автозаполнение=Ложь; - это фигня на страницу?

(8) так там в основном планы обмена не автозаполнение, а ручное заполнение изпользуют. С этой строчкой вы будете в полной заднице.

(9) не понял - почему в заднице да еще и в полной (чего полной?)

там - это где
используют - кто?

щас только что загрузил 20 000 элементов, как было до этого зарегистрировано по всем узлам 90000 так и осталось
вроде все нормально
(9) прекратите пугать своей задницей приличных людей