Проблема в следующем: в организации ведется два журнала входящих документов. В первый попадают входящие от вышестоящей организации, а во второй все остальные входящие документы. У каждого журнала своя нумерация. Простейший вариант - сделать две папки во входящих, но он не прокатывает, поскольку справочник входящие документы не иерархический. А ломать конфу не хочется.
Можно ли как-то реализовать это настройками в режиме предприятия?

Сделайте два разных вида входящего документа. И нумераторы могут быть разные, и права.

(0) Нумераторы

Хм.. Видов входящих у меня уже штук 7 (писмо, постановление, заявление и т.д.). В общем не подходит.

(2) Так. С нумераторами понятно. Вопрос такой: как сделать разделение в списке входящих. Чтобы у юзеров была возможность просматривать два журнала раздельно, а не вперемешку общим списком?

Включите учет по организациям в настройках

(5) Организация одна. В ней два журнала входящих.

(6) Пробовал курить "Режим просмотра", но там тоже всё немного не в ту степь.

иппать на вас не угодишь.
Есть еще учет по вопросам деятельности.

а может просто отправителей вышестоящие организации запихать в одну папку, а всех остальных в другую и смотреть с отбором по папке отправителей

(9) А отдельная нумерация тогда как?

(8) Спасибо. Сейчас гляну.

(10) в нумераторах есть Индекс Корреспондента

(10) индекс вопроса деятельности в нумераторе есть

(12)(13) Да. Похоже что-то вырисовывается. Не совсем так как хотелось бы, но на безрыбьи и рак - рыба. ) Всем спасибо. Буду извращаться. )

(0) Используем нумераторы. Вышестоящую организацию помещаешь в корреспондентах в отдельную группу, других также в отдельную.
Создам два нумератора - один для вышестоящей, другой для остальных. В Формате номера указываем что считаем нужным. Главное настроить в "Действует для" в поле Корреспондент для каждого из нумераторов выбрать свою группу корреспондентов.
Ни в коем случае не трогайте вопросы деятельности для разделения нумерации и т.п., они Вам еще пригодятся.