Есть такой запрос:
Запрос.Текст =
    "ВЫБРАТЬ
    |    ТМЦкВыдачеОстатки.ТМЦ,
    |    ТМЦкВыдачеОстатки.ВариантТМЦ,
    |    ТМЦкВыдачеОстатки.ЦелевоеНазначение,
    |    ТМЦкВыдачеОстатки.Проект,
    |    ТМЦкВыдачеОстатки.ЦелевойОбъект,
    |    ТМЦкВыдачеОстатки.КоличествоОстаток
    |ИЗ
    |    РегистрНакопления.ТМЦкВыдаче.Остатки(
    |            &ТочкаИтогов,
    |            Организация = &Организация
    |                И Склад = &Склад
    |                И (ТМЦ, ВариантТМЦ, ЦелевоеНазначение, Проект, ЦелевойОбъект) В
    |                    (ВЫБРАТЬ
    |                        ПереченьТМЦвДокументе.ТМЦ,
    |                        ПереченьТМЦвДокументе.ВариантТМЦ,
    |                        ПереченьТМЦвДокументе.ЦелевоеНазначение,
    |                        ПереченьТМЦвДокументе.Проект,
    |                        ПереченьТМЦвДокументе.ЦелевойОбъект
    |                    ИЗ
    |                        ПереченьТМЦвДокументе)) КАК ТМЦкВыдачеОстатки


ПереченьТМЦвДокументе - это временная таблица. Суть в том, что из регистра выбираются записи, отфильтрованные в соответствии с табличной частью документа. Так вот проблема в том, что почему-то в фильтр не попадают записи, когда Проект - пустая сылка (и в регистре и в документе). Проект - тип Справочник.Ссылка. Тип не составной и в регистре, и в документе. В чем может быть проблема, кто подскажет?

Вот по сути, точно такой же запрос, при этом все работает:
Запрос.Текст =
    "ВЫБРАТЬ
    |    ОстаткиТМЦ.ТМЦ,
    |    ОстаткиТМЦ.ВариантТМЦ
    |ИЗ
    |    РегистрНакопления.ОстаткиТМЦ.Остатки(
    |            &ТочкаИтогов,
    |                (ТМЦ, ВариантТМЦ) В
    |                    (ВЫБРАТЬ
    |                        ПереченьТМЦвДокументе.ТМЦ,
    |                        ПереченьТМЦвДокументе.ВариантТМЦ,
    |                    ИЗ
    |                        ПереченьТМЦвДокументе)) КАК ОстаткиТМЦ

может быть итоги битые или еще что
попробуй на тестовой пересчитать итоги

попробуй, для теста, более простое условие без В
где есть пустой проект

(0) связывать по NULL и Неопределено низяяя

Блин, вчера инет убился, после того, как вопрос задал. В общем, оживляю тему. По поводу битых итогов и проверки - если не делать фильтрацию, а делать соединение, то все работает. Т.е. пустой проект в документе и пустой проект в регистре соединяются и попадают в одну строку.

(4) Так я вроде там нигде ничего не связываю...

(6) Да и NULL у меня там нигде не может быть.

А через внешнее соединение остатков с таблицей ПереченьТМЦвДокументе есть пересекающиеся строки?

(5) что за соединение?

Соединение табличной части с регистром.

(8) есть через любое соединение. Т.е. при соединении запрос видит, что ДокТЧ.Проект = Рег.Проект, а если делать фильтр, как у меня в запросе, то в этом случае они типа не равны.

(11) поропробуй то что я посоветовал
покажи другие запросы, которые пробовал