я ведь правильно понимаю, что

ВЫБРАТЬ
  *
ИЗ
  МояТаблица
ГДЕ
  МояТаблица.Реквизит = &Ссылка
  И ВЫБОР КОГДА &Ссылка = ЗНАЧЕНИЕ(Справочник.МойСправочник.ПустаяСсылка)
    ТОГДА ЛОЖЬ
    ИНАЧЕ ИСТИНА
  КОНЕЦ

оптимальнее чем

ВЫБРАТЬ
  *
ИЗ
  МояТаблица
ГДЕ
  ВЫБОР КОГДА &Ссылка = ЗНАЧЕНИЕ(Справочник.МойСправочник.ПустаяСсылка)
    ТОГДА ЛОЖЬ
    ИНАЧЕ МояТаблица.Реквизит = &Ссылка
  КОНЕЦ

?

С чего это? Думаете, оптимизатор запросов настолько тупой, что не сможет применить индекс при условии внутри ВЫБОР КОГДА?

(1) не знаю, потому и спрашиваю

имхо - нет, 2-й лучше.
Хотя надо смотреть план запроса, а то это сферический запрос в вакууме

а че не
ГДЕ МояТаблица.Реквизит = &Ссылка
И МояТаблица.Реквизит <> ЗНАЧЕНИЕ(Справочник.МойСправочник.ПустаяСсылка)

(4) вариант :)

(3) дык это в скуль нужно лезть, время...

Объясните дурачку зачем пихать ВЫБОР в ГДЕ ?

(6) чтобы отобрать нужные записи из таблицы

(7) это я понял. чем оно лучше (4) ?

Я реально первый раз такое вижу, даж не знал, что так можно.

Прикольно. Работает.
Буду использовать, если нужно будет ещё сильнее уменьшить читаемость запросов :)