Или ничего не делает, или грузит проц, иногда много иногда не очень.

с какой стороны подойти?

Наверное с указания версии платформы и конфигураций, которые крутятся на сервере

8.3.5.1248

самописка

ясно, понятно.
спросить версию и развести руками. это мы могем

На файловом варианте базы фоновые криво работают.

(3) а ты думаешь все сидят и ждут, ну когда же ты ответишь на очевидный вопрос? :)
Смотри, какие в этот момент работают фоновые задания, делай выводы. Может есть какая то периодически вызываемая процедура и ее код не оптимален.
(4) в чем кривизна?

(5) В том, что их там нет в принципе? :)

(5) вопрос не в том, что надо все поменять. надо понять причину.

для простоты - одно задание. в одном случае из 10 оно зависает. Клиент - делает отчеты. 1 из 10 зависает. Один и тот же отчет. Сложный, много настроек.

(6) фоновые задания сперли? вроде версия 8.3
(7) смотреть запрос отчета только...

(7) Для затравки:

Делаешь лог значимых блоков отчета в журнал регистрации. Нужно залогировать большинство действий отчета.

Дальше смотришь где лог заканчивается.

Делаешь замер производительности кода отчета не в ФЗ, а во внешнем отчете. Смотришь как там по времени и по логам

(9) Если блок, который зависает всегда один, пиши сюда, чего за чудо, будем думать.

(7) да, фоновые зависают на файловой базе при формировании отчета на СКД например. Часто такое происходит. В случае отчетов запускаем в режиме "непосредственно". Либо тестировать на клиент-серверном варианте, если есть возможность.

Может с винчестером проблемы?
__________
http://www.privarka-k97.ru/engine/glossary/zakladnaya_gaika.html