Есть 2 базы. Получилось так что номенклатура вбита и там и там.
При переносе нет возможности искать номенклатуру, так как разные и коды и наименование и реквизиты. Но есть возможность поменять коды в базе источнике на коды в базе приемнике, что бы номенклатуру искать по коду. Обмен ведется документами.
Если вручную менять коды у существующей номенклатуры и в последствии вручную задавать коды для новой номенклатуры, как это может повлиять на ввод номенклатуры новой которой нужно присвоить код стандартным автоматическим механизмом?

Было 000005
Ввели 001
Далее будет 002
Например!

Потестируй, чо.

отдельный реквизит
или
отдельный регистр
синхронизировать номенклатуру, не?

Правь коды в источнике, либо приемнике.
Сквозная нумерация должна подхватить.
Лучше ещё для надежности правила обмена допилить немного: оставить синхронизацию только по коду.

(4) я и хочу синхронизировать только по коду, так как так и должно быть. Сейчас вот решается вопрос о изменении кодов в источнике.

(3) ну можно и так, но если просто делать коды как в приемнике, тоже же вариант.

(1) а если коды типа 00000015542, а менять нужно на 00-00008199, потом если ставить 00000015543, нумерация снова же пойдет автоматически?

(3) или как вариант сделать дополнительный реквизит "КодВИсточнике", проставить его, что бы не менять основной код делать поиск по нему.

Нормально же делать поиск элемента номенклатуры по этому  реквизиту при загрузке, КодВИсточнике?

(5) нет. пойдет будет с дефисом
(6) да я про это и говорил
(7)  нормально

Синхронизацию по ссылкам не предлагать? 1с слишком любит издеваться над кодом, чтобы по нему синхронизацию делать - то префикс добавит, то дефисы, то вообще из форм скрывает (привет УТ). +еще любят издеваться над кодом сами пользователи

(9) как это синхронизация по ссылкам?