(
0) "то есть что то делает" - в журнале регистрации посмотри что именно конфигурация в это время делает.
Там регламентные (фоновые) задания оставляют записи о начале и окончании своей работы.
И если "висит" программа именно по этой причине, то заданиям можно изменить расписание работы на более удобное для Вас. Внешняя обработка, которая этопозволяет сделать, называется "Консоль заданий" и её можно скачать с ИТС