Конфигурация БП 1.6. Есть контрагент-поставщик, по нему создан договор в валюте EUR. Делаем покупку товара, валюта EUR. А выплатить за данную покупку надо в валюте USD. Подскажите как данная выплата реализуется в 1с (какими документами, возможно надо еще договор заводить)?

ВЭД? Паспорт сделки открыт?

(0)Вы наверное не о том :)

Просто если я делаю обычным платежным поручением: ставлю расчетный счет долларовый, договор евровый, то при проведении ругается что ни одна, ни другая валюта не является валютой регламентированного учета.

(2) о том, о том (в том числе)

если чисто технически ругается это понятно. Она просто не понимает, скорее всего...
как она тебе кросс-курс посчитает...?

(3)Тогда что такое паспорт сделки? :)

Паспорт сделки открывается в банке когда сумма договора или сумма сделки (одноразовая) превышает 50 000$ долларов. если этого не сделаете - банк не пропустит, повиснут на транзите.
Если с транзита не переведете на валютный в течении 15 раб.дней - будут штрафы. вроде так...
.
Может вам мою жену бухгалтером по ВЭД взять?

(4)Ну что-то не понимает, если вы о том чтоб отключить проверку, то я конечно могу и допрограммировать проводки тоже могу, но хотелось бы как-то штатными средствами оплату сделать.

Хотя ХЗ как там у нас на Родине, в РБ.
читайте валютное законодательство свое и инструкции ЦБ РБ

(6)С оплатой через банк все нормально. Вопрос исключительно, каким образом сделать проводки в 1с?

(7) Ну заведи доп.договор.
Ручками пересчитай евро-доллары.
Перекинь на допдоговор соотв.сумму.
погаси по доп.договору

сделай конвертацию долга на 60 счете из договора-евро в договор-доллары через "транзитный" рублевый счет