Пытаюсь с помощью "Выгрузки и загрузки данных XML", но что-то долго очень ничего не происходит.
Есть какой-нибудь другой инструмент?

Всего-то пара регистров. Регистраторы и ссылки в обоих базах есть.

И период не большой. Полмесяца.

выбрать период поменьше. проверить работает ли перенос, замерить время. экстраполировать, запастись кофе.

Конфигурации одинаковые, но не идентичные. Потому и тупит. Потому что на передаче ссылочных данных тормозит.

(4) Идентичные. Пока даже не приступал к загрузке. Все еще выгружает.

(0) А перепровести регистраторы? Вполне рабочий инструмент.

(5) Если идентичные - тогда это РИБ.

(6) Если бы.

(7) Не РИБ, а вчерашний бэкап.

(8) А в чем проблема?

(9) Регистраторы и движения не соответствуют.

Хрень какая-то. Файлик уже 10 гектар, а прогресс бар не шевелится.

(0) Если сам регистр большой, выгружай регистраторы С ДВИЖЕНИЯМИ.

(10) Так у вас база поломанная? Тогда нечего ожидать корректной работы от этой обработки.

(10) Что значит фраза "Регистраторы и движения не соответствуют. "?

(11) Не понял. А смысл? Данных же только прибавится.

(12) База целая.

(13) После одного из экспериментов, очистили пару реквизитов табличной части документов. Движения остались.

Может отбор по периоду не там/не так установлен? 10Гб на полмесяца с 2х регистров всё же многовато если не суперучетная база.
Посмотри сколько записей...

(16) + Убери флажок "выгружать при необходимости"

(15) Хотите по движениям восстановить документы?

(8) "Не РИБ, а вчерашний бэкап." - а кто мешает временно поднять РИБ из рабочей базы и базы, поднятой из архива? Дел на пару минут - добавить узлы в план обмена РИБ, а в базе архива - тоже самое, но взаимно переставить записи (коды). Тогда можно в архиве зарегистрировать нужные изменения (напоминаю: документы и их движения - автономны) и они с обменом мигрируют в базу со скоростью, недостижимой для универсальной выгрузки/загрузки XML.

не выгружай по ссылкам

(0) Флажки "при необходимости" как расставлены? по умолчанию? так у вас сейчас вся база выгрузится в xml