Подскажите пожалуйста откуда гтд попадает в счет фактуру? Где они хранятся.

В реализации

(1) из какого справочника/регистра гтд попадает в реализацию при вводе номенклатуры?

посмотри забалансовые счета.

(2) Из карточки номенклатуры, но можно руками поменять

(4) в карточке можно записать только 1 гтд, а их на самом деле может быть счетное множество.

(5) в карточке, тот который по умолчанию.

(4) (6) Если залезть в гтд реализации то будут показаны остатки по разным гтд, интересует где они хранятся, просто из документов или все же где-то отдельно.

(7) я же намекнул в (3)

(8) Не силен в терминологии бух, гугл ссылается на оборот-сальдовую ведомость, там есть счет гтд, где хранятся данные я так и не смог найти

(9) тогда регистр бухгалтерии хозрасчетный, отбор по счету ГТД

может поступление товаров? намек

а там оформление таможенной декларации