Списание делается в КА2, выгружается в банк, из банка загружается выписка целиком - при этом списание появляется второй раз.

Наверное, по аналогии с тем, как обрабатывается банк в бух базе:
- нужно сделать поручения. Они выгружаются.
- при загрузке выписки банка создаюстся списания, подвязанные к поручениям.

Возможно, что в обработке загрузка не хватает настройки, которая заставляет создавать списание...

Кстати, а проверяли, чтобы списания создаваемые вручную были связаны с поручениями?

так нет, вроде, поручений!
Я такого документа не нашла. в бп3.0 есть.

Косяки в реестре документов

(2) А каким способом обмен с банком?
По идее, там строчка с уникальным номером должна гулять туда-обратно. Может не находит при загрузке, потому и генерит еще один документ

нет в файле никакого уникального номера, даже поля такого не обнаружила.

(3) как проверить? Что может быть не так?

(3) как в Ералаше.. "дяденька, дяденька, а я знаю что у вас сломалось"

(6) есть регистра "Реестр документов", и есть  справочник "Ключи реестра документов". Можно открыть через "Все функции". Там в форме списка справочник есть команды для удаления дублей.

Технически он не отображает документы как есть, а использует эти 2 служебных документа. Т.е. если удалить запись из регистра он пропадет из журнала, хотя сам документ никуда не денется. И обратная ситуация если в справочники клбчи будут дубли, то и в реестр будет сделана запись по каждому элемента отдельно. В результате у нас будут 2 одинаковых документа в журнале.

Скорее всего там проблема.

А почему она - тут хз. Обычно такое бывает после корректировки данных (например почистили дубли контрагентов и у нас появилось 2 записи со старым и новым, так как в ключах осталась старая запись и родилась новая)

(0) Открываем файл выписки, проверяем корректность

Смотрим в задублированные документы, копируем в буфер Р/С Контрагента
идём в справочник "БанковскиеСчетаКонтрагентов" и ставим отбор по номеру счёта
Если их несколько, то проверяем Владельца

Такое бывает при косяках в справочнике Р/С,
когда одинаковый счёт привязан к более чем одному Контрагенту,
например, 3812* - зачисление на карт счета или 690* - расчёты через казначейство

Стандартная загрузка ищет в БД Р/С и через владельца получает Контрагента

Потом среди имеющихся документов по, примерно, такому ключу:
   Контрагент, Р/С, НомерВходящего, ДатаВходящего
получает имеющиеся документы и, что предсказуемо, не находит оные т.к. Контрагент не соответствует

(6) Удалить дубли в РС РеестрДокументов. Может на форме набора записей РС и кнопочка есть.
Могу прислать простенькую обработку. Только она сделана не слишком спортивно: нужно код проверить.

(10)+ Проверьте сначала это видно 2 экземпляра или это 2 документа.

(0) может ещё дело нумерации, в том смысле что сбилась по внутреннему движению денсредств , анализируй вместе с префиксами

(3) вот сижу чищу этот регистр в ЕРП2

(8) нет, совсем не там. Это реально 2 разных документа.

(9) один счет.