У многих свойств элементов формы есть вариант значения "Авто".
Эти авто-значения жёстко прописан в движке, или из можно поменять в свойствах конфгурации?
Если можно, то где?

Это значит, что значение этого свойства будет выставлено автоматически в зависимости от другого значения. Например, если у реквизита установлено свойство "Проверка заполнения - выдавать ошибку", то у свойство "Автоотметка незаполненных - Авто" значение "Авто" будет как "Да"

(1) А, например, реквизит "ВыборЭлементовИСправочников"? Его "Авто" где устанавливается?

(2) В открываемом списке справочника, в элементе на управляемой форме

(0) от платформы зависит. Или (1)
Например положение строки поиска в зависимости от режима совместимости имеет "авто" разные значения.

(2) В чём и вопрос: Если там стоит "Авто", а не контретный вариант: "Элементов", "Групп", "Групп и элементов", где определяется, каким из трёх конкретных вариантов будет "Авто"?

(5) в реквизите объекта

(6) в каком реквизите? Какого объекта?

(7) того, который в пути к данным

(8) А общий для всей конфигурации есть?
Поменял в одном месте с "Элементов" на "Групп и элементов" и во всех полях всех форм, где стояло "Авто", оно стало восприниматься как "Групп и элементов"?

(9) это прям сломает бизнес логику сразу

(10) Почему?

(11) Потому что значение "Авто", это не строгое указание режима. Это указание на то, что поведение определятся в каждом случае заново по текущему состоянию формы.

(9) Нет такого.