В документах реализации, Материалы уходят с 10х счетов сходу на 90.02 (себестоимость). Как настроить 1с, чтобы они, материалы, пробегали в своем маршруте через 20(26) счет?

Для этого надо продавать не материалы, а продукцию из них.

Дт 20 Кт 10 отгрузка материалов в производство
Дт 41 Кт 20 выпуск продукции (товары)
Дт 62 Кт 41 отгрузка продукции
Дт 50 Кт 62 приём оплаты за продукцию

(2) а выручка и себес? ))

(3) Допишите там

(1) ок! а если у нас услуги, в которые используются материалы? Тоже оформлять как продукцию?**

(5) списывайте материалы в производство, выставляйте услуги отдельно.
Котлеты от мух отделяйте

(5) Это уже смахивает на обычный заказ-наряд

(5) Да, это так и есть, это заказ-наряд, к которому идут материалы. Бухгалтерия хочет пропускать материалы через 26й счет.

(8) "Бухгалтерия хочет пропускать материалы через 26й счет"

Зачем ?
Если материалы идут известному заказчику, эти затраты нет нужды размазывать по сч 26

Так вы контрагенту то что реализуете материалы или какую-то комплексную услугу?

(10) Разве реализация услуги исключает использование материалов ?
Помыть окна к примеру, услуга в чистом виде, но на клиента уйдет и материал: жидкость для мытья, тряпки и проч.

стоимость материалов, использованных при выполении работ - (имхо) через сч26 не корректно, т.к.
ФСБУ 5
"18. В себестоимость приобретаемых (создаваемых) запасов не включаются:
б) управленческие расходы, кроме случаев, когда они непосредственно связаны с приобретением (созданием) запасов;"