а скажите в каком случае в документ оплата по больничному листу , в оплату попадает сумма в колонку "в т.ч за счет федерального бюджета"??

(0) Когда у физлица не заполнен "Стаж для оплаты больничных листов", а заполнен только "Стаж для оплаты б/л с учетом нестраховых периодов". Если есть последний, у физлица должны быть обе записи о стаже, если нет, то только первая.

И не только. Разнообразные чернобыльцы, матери детей-инвалидов и т.п. также получают 100% оплаты больничного, разницу между обычно начисленной суммой и полной суммой соцстраху возмещает именно федеральный бюджет.