Как в ЗУПе сделать начисление, которое бы облагалось взносами в ПФР, но не облагалось взносами ТФОМС и ФФОМС?

на основании чего так должно быть?

на основании того что это труд студенческого стройотряда

(2) Читаем дополнение к описанию.

только если это строй отряд то и ПФР не берется и в стаж не включается

Страховые взносы во внебюджетные фонды в 2011 году
   Реализован расчет взносов с выплат в пользу обучающихся в образовательных учреждениях среднего профессионального, высшего профессионального образования по очной форме обучения за деятельность, осуществляемую в студенческом отряде, в соответствии с пунктом 1 части 3 статьи 9 Федерального закона от 24.07.2009 № 212-ФЗ (в ред. Федерального закона от 28.12.2010 № 428-ФЗ).
   Включить такой расчет можно на закладке "Расчет зарплаты" формы настройки параметров учета. Далее в форме редактирования данных сотрудника-студента, принятого по трудовому договору, следует взвести флажок "Является студентом работающим в студенческом отряде", или в заключаемом со студентом "Договоре на выполнение работ" - флажок "Заключен со студентом, работающим в студотряде". Начисленные по таким договорам суммы не будут облагаться с 2011 года страховыми взносами в ПФР, а время работы - не будет включаться в страховой стаж для персонифицированного учета ПФР.