Делаю guid'ы известным способом:
НТТРСистИнформ = СоздатьОбъект("AddIn.V7SysInfo");
id = СокрЛП(НТТРСистИнформ.СоздатьGUID());
похоже, они у меня получаются далеко не случайными, а повторяются.
Может ли такое быть?

похоже, или получаются?

Расставляю гуиды в реквизит документа, по одному на документ. Даже если допустить проход по одному документу два раза, задваиваться они не должны, а задваиваются.
То есть, сегодня "пронумеровал" кучу документов, завтра другую кучу - и в этой куче часть гуидов пересекается со вчерашними.

Все, нашел косяк, сам дурак, тему закрывать.