Суть в чем. Для последовательности по всем вариантам значений измерений устанавливаю некую дату. В итоге в штатной обработке восстановления последовательности вижу такую картинку: (<Некий документ на котором последовательность была изначально>) - (<Моя дата>).
Причем это касается только той последовательности, у которой два измерения. В частности это УПП и последовательность ПартионныйУчет.

Как ее почистить грамотно и установить на нужную дату?

Кусок кода устанавливающий ее:

Отбор    = Новый Структура;
Отбор.Вставить("Организация",    Организация);
Отбор.Вставить("ПроведенВХронологическойПоследовательности", Истина);
   
Последовательности.ПартионныйУчет.УстановитьГраницу(ДатаГраницы, Отбор);

Отбор    = Новый Структура;
Отбор.Вставить("Организация",    Организация);
Отбор.Вставить("ПроведенВХронологическойПоследовательности", Ложь);
   
Последовательности.ПартионныйУчет.УстановитьГраницу(ДатаГраницы, Отбор);

Собственно ап.

И снова ап. Неужели ни у кого не было проблемы такой?

а в настройку обработки не пробовал заходить

(5). Пробовал, но не увидел как можно установить последовательность на нужную дату.