Не вижу, в чем ошибка? Нужно получить Склад, номенклатуру и остаток колДт и сумДт?
ВЫБРАТЬ
Остатки.Субконто1 КАК Номенклатура,
СУММА(Остатки.СуммаОстатокДт) КАК СуммаОстаток,
СУММА(Остатки.КоличествоОстатокДт) КАК КоличествоОстаток,
Остатки.Субконто2.Наименование
ИЗ
РегистрБухгалтерии.Хозрасчетный.Остатки(&КонецПериода, Счет = &Счет, , Субконто2 = &Склад) КАК Остатки
ГДЕ
Остатки.КоличествоОстаток > 0
СГРУППИРОВАТЬ ПО
Остатки.Субконто1,
Остатки.Субконто2.Наименование