Оприходовали товар как оптовый с выделением на 19.03 счете НДС.
Но часть продали через розницу С ЕНВД. Таким образом мы должны же сторнировать НДС на 19.03 счете на кол-во проданного товара в розницу.. 1С-ка это не делает? Или руками разбивать поступление, часть на оптовый склад, часть на розничный (задним числом - это конечно бред). Какие варианты?

Все делается автоматом читайте ИТС