Как правильно ввести остатки на расчетных счетах? Каким документом?
Спасибо заранее.

https://1cers.ru/rules.php#rec

(0) платежкой,
например от собственного контрагента

подробнее смотри на ИТС статью по УПП, на 90 % она для КА годиться

http://its.1c.ru/db/metod81#content:2793:1