В счет фактуре полученной появился реквизит "ВозможностьОтразитьВычет". При открытии этот реквизит устанавливается в Истина. При проведении счет фактуры она закрывает регистр "НДСПредъявленный". В следствии чего возврат, на основании которого создана счет фактура, не попадает в книгу покупок.
С какой целью это сделано?

Извеняюсь, поторопился не ВозможностьОтразитьВычет, а НДСПредъявленКВычету

правильно говорить "при открытие", "устанавливаеться"

При возврате поставщику выписывается счет-фактура, который должен отражаться в книге продаж.