1. Документы берутся из Документы->ПлатежноеПоручение?
2. Пользователь устанавливает интервал дат и из этого интервала выгруужаются все платежки? Или же система определяет, что уже было выгружено из 1с в Банк-Клиент?

да, система не хранит ничего об выгруженных уже - фиг его знает.. может ты просто так выгрузил...

(1) некоторые системы Кл-б учитывают это при загрузке, и не загружают повторно