Документы в бухгалтерию выгружаются из внешней программы.
Периодически возникает задача объединения контрагентов во внешней программе и соответственно в бухгалтерии. Перенос задолженности в текущем периоде одним документом невозможен ( нарушается механизм обмена ) Нужно заменить реквизит в старом периоде в доках и проводках не перепроводя доки. Может есть уже такая обработка ?

(0) в УПП есть замена повторяющихся элементов справочника, которая не перепроводит документы

Есть. ПоискИЗаменаЗначений называется. На ИТС
Только с авансами херня будет (в общем случае)

а если у контрагента два одинаковых договора и их нужно объединить, при этом таких контрагентов 1000 - кто-нить пробовал упростить такой процесс?

(3) 1. Немного меняете ПоискИЗаменаЗначений: при открытии определяете, что на что менять. Дальше поиск ссылок и замена. Потом можно пометить на удаление все договора и попробовать удалить. Только не уверен, что документы при этом не перепроводятся: скорее всего Объект.Записать(), т.е. документ перепроводится.
2. Определить, что на что менять и воспользоваться поиском ссылок и их заменой, одновременно помечая договора на удаление.

(4) можно ли менять субконто в существующих проводках и не перепроводить документы

потом пересчитать итоги

(4) как раз Объект.Записать() - документ не перепроводится

(5) Через набор записей регистров бухгалтерии.
(7) При использовании ПоискИЗаменаЗначений движения и проводки менялись.

(8) разве что аналитика в движениях, но через Записать()