Счета-фактуры из документа "поступление доп расходов" не попадают в журнал учета полученных и выставленных счетов фактур по постановлению 1137. Так и должно быть? Где почитать об этом?

Так быть не должно.
Попробуйте, что-ли, заполнить данные на закладке "Счет-фактура" в самом документе.