Отпуск может предоставляться в календарных днях (обычный Ваш отпуск) и в рабочих (например, для работников детских учреждений). В последнем случае он рассчитывается по 6-ти дневной рабочей неделе с выходным днём в воскресение.
(4)У Вас какая конфигурация, давайте начнём с этого. Если 1С:ЗУП, то там в ПВР "Основные начисления" есть ВР "Оплата отпуска по календарным дням" - это тот самый отпуск, который обычно составляет 28 дней, и есть "Оплата отпуска по шестидневке". Они и настраиваются по-разному, прежде всего в части способа расчёта среднего.