Подскажите Как задать группировку в СКД программно

Настройки=КомпоновщикНастроек.Настройки;
Структура=Настройки.Структура;
НоваяГруппировка=Структура.Добавить(Тип("ГруппировкаКомпоновкиДанных"));

и настраиваешь группировку

В видео-курсе по СКД Гилева достаточно подробно рассматривается. В типовых вроде видел готовые функции для подобных целей.