Хочу открыть модально Управляемую произвольную форму и установить значения ее реквизитов.

В форме есть Реквизит "Контрагент".

Как передать его в форму и где в форме разобрать?

а так разве нельзя? или я ошибаюсь?
ФормаДок = Документы.НужныйДокумент.ПолучитьФорму("Форма");
МойКонтрагент = ФормаДок.ОткрытьМодально();

передаешь в параметры, при создании на сервере читаешь из параметров

(1) Спасибо, че-то я про получитьФорму совсем забыл