Демонстрационная конфигурация "Библиотека стандартных подсистем".
В любом отчете - жмем кнопку "Изменить вариант", меняем вариант, завершаем редактирование. И далее, чтобы настройки из варианта попали в пользовательские настройки, надо нажать кнопку "Установить стандартные настройки". Киньте, пожалуйста, пример кода, как это действие выполнить программно.

(0) Шо, опять?

(1) вопрос опять по СКД, но про другое.

не едут лыжи.

(3)Или ты ...

Получился такой рабочий код изменения вариант. Осталось, думаю, перебрать элементы коллекции НовыйНастройки.Элементы и втулить их в ПользовательскиеНастройки.

&НаКлиенте
Процедура ИзменитьВариант(Команда)

   ФормаНастроек = ПолучитьФорму("Отчет.ТоварыНаСкладах.Форма.ФормаВарианта");
   ФормаНастроек.Отчет.КомпоновщикНастроек.ЗагрузитьНастройки(Отчет.КомпоновщикНастроек.Настройки);
   
   Рез = ФормаНастроек.ОткрытьМодально();
   Если Рез = Истина Тогда
       
       НовыеНастройки = ФормаНастроек.Отчет.КомпоновщикНастроек.Настройки;
       УстановитьНастройки(НовыеНастройки);        
   КонецЕсли;
КонецПроцедуры

&НаСервере
Процедура УстановитьНастройки(НовыеНастройки)
   
   ОбъектОтчет = РеквизитФормыВЗначение("Отчет");
   ОбъектОтчет.КомпоновщикНастроек.ЗагрузитьНастройки(НовыеНастройки);
   ЗначениеВРеквизитФормы(ОбъектОтчет, "Отчет");

КонецПроцедуры // УстановитьСхемуКомпановкиНаСервере()

Установка пользовательский настроек при изменении варианта в окончательном виде:

&НаКлиенте
Процедура ИзменитьВариант(Команда)
   
   ФормаНастроек = ПолучитьФорму("Отчет.ТоварыНаСкладах.Форма.ФормаВарианта");
   ФормаНастроек.Отчет.КомпоновщикНастроек.ЗагрузитьНастройки(Отчет.КомпоновщикНастроек.Настройки);
   
   Рез = ФормаНастроек.ОткрытьМодально();
   Если Рез = Истина Тогда
       
       НовыеНастройки = ФормаНастроек.Отчет.КомпоновщикНастроек.Настройки;
       УстановитьНастройки(НовыеНастройки);        
   КонецЕсли;
КонецПроцедуры

&НаСервере
Процедура УстановитьНастройки(НовыеНастройки)
   
   ОбъектОтчет = РеквизитФормыВЗначение("Отчет");
   ОбъектОтчет.КомпоновщикНастроек.ЗагрузитьНастройки(НовыеНастройки);
   
   ПользовательскиеНастройки = ОбъектОтчет.КомпоновщикНастроек.ПользовательскиеНастройки;
   Для каждого ПользНастройка Из ПользовательскиеНастройки.Элементы Цикл
       
       ИД_ПользНастройки = ПользНастройка.ИдентификаторПользовательскойНастройки;
       
       Если ТипЗнч(ПользНастройка) = Тип("ЗначениеПараметраНастроекКомпоновкиДанных") Тогда
           Для каждого Настройка Из НовыеНастройки.ПараметрыДанных.Элементы Цикл
               Если Настройка.ИдентификаторПользовательскойНастройки = ИД_ПользНастройки Тогда
                   ПользНастройка.Использование    = Настройка.Использование;
                   ПользНастройка.Значение        = Настройка.Значение;
                   Прервать;
               КонецЕсли;
           КонецЦикла;
       ИначеЕсли ТипЗнч(ПользНастройка) = Тип("ЭлементОтбораКомпоновкиДанных") Тогда
           Для каждого Настройка Из НовыеНастройки.Отбор.Элементы Цикл
               Если Настройка.ИдентификаторПользовательскойНастройки = ИД_ПользНастройки Тогда
                   ПользНастройка.Использование = Настройка.Использование;
                   ПользНастройка.ПравоеЗначение= Настройка.ПравоеЗначение;
                   Прервать;
               КонецЕсли;
           КонецЦикла;
       КонецЕсли;
   КонецЦикла;
   
   ЗначениеВРеквизитФормы(ОбъектОтчет, "Отчет");
КонецПроцедуры // УстановитьНастройки

О... Кстати. Так бы сразу и спросил в (0) "Как программно перенести пользовательские настройки в настройки отчета?". (6) Вот только коллекцию НовыеНастройки.Отбор.Элементы следует обходить рекурсивно, так как в отборах могут быть ещё и группы И / ИЛИ / НЕ неопределенного уровня вложенности.