Хочется по кнопке закрытия окна, если это основное окно, то перейти в подсистему из которой было вызвано ...

что-то типа как в БП 3.0

Если Окно.Основное Тогда
       ПерейтиПоНавигационнойСсылке("e1cib/navigationpoint/СправочникиИНастройкиУчета");
   Иначе
       Закрыть();
   КонецЕсли;
Только эту ссылку нужно узнать при открытии окна, как ссылку на текущую подсистему.

Как?

ап

Вроде не предусмотрено. Если только отталкиваться от того, что форма принадлежит одной и только одной подсистеме и зашить эту подсистему в форме или получать ее из метаданнных

Плохо