Работнику была начислена компенсация за несвоевременную выплату заработной платы, в документе "Зарплата к выплате организаций" она отображается, также отображается она и в расчетном листке. Но в документе "Отражение з/п в регл. учете" этой суммы нет. Должна ли она отражаться в этом документе?Если да, то еще вопрос как настроить способ отражения для нее в учете(корреспонденцию проводок).

В документе  "Отражение з/п в регл. учете" эта сумма стоит на закладке "Дополнительные начисления".

список начислений за месяц в расчетном листке:

Оклад
Районный коэффициент
Компенсация отпуска при увольнении по календарным дням
Компенсация за несвоевременную выплату заработной платы

список начислений в документе "Отражение з/п в регл. учете":

Основные начисления:
Оклад
Районный коэффициент
Дополнительные начисления:
Компенсация отпуска при увольнении по календарным дням

Доходы по компенсации зарегистрированы

(1)Вероятно, у вас компенсация за несвоевременную выплату занесена и рассчитывается как дополнительное начисление?меня же интересует как это должно выглядеть без его создания, если вообще это возможно.

Раз никто не комментирует - резюмирую. Считаю, что не совсем корректно заводить эту выплату отдельным начислением, ведь, по сути, расчет компенсации за задержку происходит в момент выплаты з.п., также выплата з.п. может быть произведена частями. Поэтому, не вижу ничего другого как считать эту сумму в документе выплаты, регистрировать доходы по компенсации, а потом уже ручками добавлять в документ отражения в учете эти суммы с нужными корреспонденциями.