После нескольких дней танцев с бубном, удалось определить причину ошибок при работе с сервером 1С. Проблема меня так достала, что я решил поделиться с общественностью :)

При подключении к серверу 1С из консоли получал:

Ошибка соединения с сервером 1С:Предприятия 8.2:
Ошибка на сервере или соединение разорвано администратором
Ошибка формата потока

При запуске SQLной базы получал ошибку:

Ошибка при выполнении операции с информационной базой.
Ошибка на сервере или соединение разорвано администратором.
Ошибка формата потока

Были такие темы на мисте, но в сводились к чистке серверного кеша. Это помогало, но до перезагрузки.

На самом деле причина оказалась в разыменовании Windows7 и ей подобных ОС. Нужно пропинговать себя и увидеть свой (или не свой) IP адрес.

Решение самое быстрое: В Hosts прописать свой IP и ИмяПК
Решение частное: Полностью отключить IPv6 в ОС

Вот тут http://infostart.ru/public/160388/ детально разобрано.