В этом документе не отображается отрицательная сумма, хотя должна быть. Если открыть печатную форму, то они там стоят

Сам не понял, что спросил

Немного переформулирую. Как сделать отрицательную счет-фактуру?

ап

Отрицательную СФ нельзя сделать. Можно сделать исправленный СФ  на основании уже имеющегося СФП с отрицательной суммой.