Сделал запрос по остаткам. К нему присоединил регистр цен. вывел все с помощью СКД в таблицу, где в строках - склад,номенклатура,характеристика номенклатуры, в колонках - типы цен. Ресурсы: остаток, цена.
получился отчет:
        |тип цен 1   |тип цен 2   |тип цен 3   |
        |остаток|цена|остаток|цена|остаток|цена|
товар1
хар-ка а
товар2
хар-ка б
товар3
хар-ка в

Неудобно то, что в каждой колонке повторяется колонка "остаток" - т.к. число там одно и то же - остаток товара на складе. Просто к этому остатку присоединены разные типы цен. Намного более читаемо было бы оставить колонку "остаток" вне группировки "Типы цен" и выводить ее сразу после колонки "склад\номенклатура" один раз. И соответственно внутри вертикальной группировки "типы цен" останется только колонка цена. Как это сделать не знаю.

слияние колонок СКД делать не умеет, гугли - каждую неделю этот вопрос, выход есть

Вот так можно
http://infostart.ru/public/20848/

в колонках детальные записи, поля - остаток
потом колонка группировка тип цен с полями тип цен и цена