Странный глюк. Создаем новый элемент справочника (код числовой, автонумерация), ему автоматически присваивается код N. Не записываем. В следующий раз при создании нового код уже N+1, как если бы предыдущий был записан.

Как с таким бороться ?

В свойствах конфигурации режим автонумерации объектов

Спасибо, сработало