Надо создать (может, уже есть) статью расходов. В ней указать вариант распределения - на себестоимость товаров. Аналитику расходов - либо, например, на номенклатуру (если в приходной накладной уникальная номенклатура), либо поступление товаров и услуг (тогда можно указать конкретный документ поступления). Созданную статью указать в документе - "Поступление услуг и прочих активов" (но можно и в документе поступления, если доп. расходы проще выбирать из справочника "номенклатура") В аналитике расходов указать требуемую номенклатуру, на которую надо распределить доп. расходы, или документ поступления (приходная накладная). Сумма распределится при проведении регламентных документов.
Компьютеры — прекрасное средство для решения проблем, которых до их появления не было.