Документ "Платежное поручение исходящее. Перечисление налога." переносится из УТ в БП. Там он становится документом "Списание с РС".
Счет учета автоматом проставился как 52. Счет дебета не проставился. Соответственно документ не провелся.
Должен ли автоматом проставлятся счет дебета? Где это прописывается? Среди записей регистров сведений "Счета ..." я такого не нашел.

нет не должен.
счет дебета зависит от того, како

какой налог платится
в торговле это не прописывается никак

т.е. это придется каждый раз вручную проставлять в БП ?

(3) Переходите на УПП - там все реализовано :)