Через обработку Клиент банка загружаю рлатежки для двух организаций в одну буху. Входящие номера иногда совпадают в разных организациях, и получается что документы одной организации переписывают документы другой.
Как победить?

Была идея добавлять к документам префикс с имени расчетного счета. или организаций. У нас случай был организация одна 2 клиент банка, а клиенты забивают платежки в интернете.

В документе и без того есть реквизит Организация

Почему-то в запросе не проверяется условие

ПлатежныеДокументы.Организация = &Организация

там проверяется расчетный счет. Поэтому никак не может у вас попасть на другую организацию. У нее ведь другой расчетный счет.

Расчетный счет одинаковый, организации разные, проверяется и счет, и организация. Мне кажется запрос косячит.

у двух организаций не может быть одинаковый расчетный счет.

Действительно, счет тоже разный. Просто под фильтр попал, я подумал он всего один.

Тогда в запросе не срабатывают два условия

|    И ПлатежныеДокументы.Организация = &Организация
       |    И ПлатежныеДокументы.СчетОрганизации = &СчетОрганизации

Вот текст косячного запроса, ошибку нашли уже:
ВЫБРАТЬ РАЗРЕШЕННЫЕ
    ПлатежныеДокументы.Ссылка,
    ПлатежныеДокументы.Проведен,
    ПлатежныеДокументы.НомерВходящегоДокумента КАК Номер,                      
    ПлатежныеДокументы.Дата КАК Дата,
    ПлатежныеДокументы.СчетКонтрагента.НомерСчета КАК НомерСчета,
    ПлатежныеДокументы.Контрагент.ИНН КАК КонтрагентИНН,
    ПлатежныеДокументы.Организация
ИЗ
    Документ.СписаниеСРасчетногоСчета КАК ПлатежныеДокументы
ГДЕ
    НАЧАЛОПЕРИОДА(ПлатежныеДокументы.Дата, ДЕНЬ)= &ДатаДок ИЛИ НАЧАЛОПЕРИОДА(ПлатежныеДокументы.ДатаВходящегоДокумента, ДЕНЬ)= &ДатаПлПоручения
    И ПлатежныеДокументы.Организация = &Организация
    И ПлатежныеДокументы.СчетОрганизации = &СчетОрганизации

УПОРЯДОЧИТЬ ПО
    НомерСчета УБЫВ,
    КонтрагентИНН УБЫВ