Клиент говорит, что оформлять сотрудника по основному месту работу в этой базе не надо, т.к. по основному он работает в другой фирме холдинга, которую ведут в другой базе.
Но тогда (если я правильно понимаю) сотрудник не попадает в расчетную ведомость - так ?
Как правильно сделать ?

внешний совместитель

(1) как бы нельзя, т.к. он работает в это же холдинге

(точости ради) Всё зависит от "другой фирмы холдинга" - того, как это реализовано в базе. Если это другая "организация" - то внешний совместитель. Если обособленное подразделение, например, - то внутренний.

(3) т.е. расчет ЗП должен работать, если сотрудник введен как внутренний совместитель без ввода в эту же базу его основного места работы (должности) ?

(4) попробуй
но возможно в некотоорых отчетах его потеряете
когда выбирается список физ лиц, из справочника сотрудников по условия <> ВнутреннийСовместитель

Холдинг-шмолдинг. Если Организация(подразделение) на выделенном балансе, то сотр внешний совместитель.

(6) ок... я тоже так и подумал когда разбирался как работает расчетная ведомость

ээээ...  а уже в существующей карточке как изменить Вид ?
- надо отменить проведение доекументов в которых он участвует ?

(8) Так второй раз принимать надо тоже физ лицо

(8) Интерактивно не поменяешь. Надо обработкой менять значение реквизита.

+(10)В твоем случае достаточно распровести.

(6)Это точно? Так именно нужно оформлять?

(12) Ну сам подумай. Выделенный баланс означает самостоятельные выплаты в фонды. Т.е. по сути это другое предприятие.

(13)Бухгалтерский баланс у нас общий, т.е. он сдается только головной организацией. По людям, в частности, в пенсионный фонд, отчитываются в местные отделения по метонахождению филиалов.

(14) кадровик должен знать ответ на этот вопрос.