Не из отчета? Те, которые дефолтно запоминаются как последние? Или ВСЕ для этого отчета и его вариантов?
ХранилищеСистемныхНастроек.Удалить(,,"ИмяПользователя") - да, сбрасывает.
А как для конкретного отчета? Пробую как в СП написано - в качестве ключа объекта "Отчет.МойОтчет/МойВариантОтчета" - не канает...

В смысле, ошибки не выдает, но и не сбрасывает.

Протупил, СП надо было внимательнее читать.
Правильно "Отчет.МойОтчет/МойВариантОтчета/ТекущиеПользовательскиеНастройки"