Предположим имеем запрос:
|ВЫБРАТЬ
   |    ""96"" КАК Счет,
   |    ХозрасчетныйОборотыДтКт.СуммаОборот КАК Сумма
   |ИЗ
   |    РегистрБухгалтерии.Хозрасчетный.ОборотыДтКт(&ДатаНач, &ДатаКон, , , , СчетКт = &СчетКт96, , ) КАК ХозрасчетныйОборотыДтКт";

Он обращается к Кредиту 96 счета, не находит там данных за введенный период. Как сделать так, чтобы в том случает он возвращал ноль.
Или как проверить таблицу значений, что у какого-то элемента не заполнено поле Сумма?

когда сумма изнулл тогда сумма = 0

ЕстьNULL

в виртуальных таблицах нет нулей

(3) Тогда как обработать результат запроса?

(2)Это писать в запросе, или в обработке результата запроса?

Выбирай из плана счетов, соединяй с регистром

(4)
Результат = Запрос.Выполнить();
Если Результат.Пустой Тогда
   Возврат 0;
Иначе
   ...
КонецЕсли;

(2) Ты это имел ввиду?
ВЫБРАТЬ
   "69",
   ЕСТЬNULL(ХозрасчетныйОборотыДтКт.СуммаОборот, 0) КАК Сумма
ИЗ
   РегистрБухгалтерии.Хозрасчетный.ОборотыДтКт(&ДатаНач, &ДатаКон, , , , СчетКт В ИЕРАРХИИ (&СчетКт69), , ) КАК ХозрасчетныйОборотыДтКт