УТ 10.3, типовая.
В одной реализации, у одного товара, в регистр ПродажиСебестоимость попадает стоимость продажи, а не себестоимость.
Причём в этом же у другой номенклатуры нормально рассчитывается Себестоимость.
У других документов, с этой же номенклатурой, в регистр ПродажиСебестоимость нормально рассчитывается Себестоимость.
На момент продажи во всех случаях товар был в наличие(ну здесь 100% не известно, но документы поступления стоят за долго до продажи).
В документах единственное разное это контрагенты.