Есть несколько приемов.
В ПередВыгрузкой(если не ошибаюсь) запросом собираешь свои данные и в цикле пишешь ВыгрузитьПоПравилу()
Соответственно в ПКО источник пустой а приемник твой регистр и заполняешь из ВхДанные
Требовать и эффективности, и гибкости от одной и той же программы — все равно, что искать очаровательную и скромную жену... по-видимому, нам следует остановиться на чем-то одном из двух. Фредерик Брукс-младший