как программно в документе реализация товаров и услуг определить что реализуеться в документе услуга или товар ?

(0) Посмотреть, какая из табличных частей заполнена (если они, конечно, правильно заполнены).
Или пройтись циклом и посмотреть реквизит Услуга у номенклатуры.

у номенклатуры посмотреть свойство.Если услугу завели как  товар чтобы не парится.