Имеется один сервер, один web server апач, два сервера 8.2 и 8.3
оба опубликованы.

работает по web только один либо 8.2 либо 8.3
в зависимости что в настройках стоит http.conf

LoadModule _1cws_module "C:/Program Files/1cv82/8.2.16.368/bin/wsap22.dll"

или

LoadModule _1cws_module "C:/Program Files/1cv8/8.3.4.304/bin/wsap22.dll"

каким образом можно настроить чтоб одновременно запускался 8.2 и 8.3

2 вебсервера на разные порты.

засада :-(

(2) почему ? Проксируй с помощью апача.