У меня не формируется отчет Анализ движения затрат (РАУЗ). Но дело не сколько в этом, а столько в том что правильно что в разделе учета стоит МПЗ, а не Товары отгруженные? (по БУ продается все конечно же с 41-го счета)

ставится то, что заполнено в макете регистра

а где этот макет регистра?

у регистра )

(0) 1. При продаже с 41 должно быть МПЗ. Товары отгруженные при отгрузке без перехода права собственности.
2. Если записи есть - то должно быть и в отчете.
Какая конфигурация?