SELECT    
    Рег.Склад as [Скл as $Справочник.Склады],
    Рег.Номенклатура as [Номенклатура $Справочник.Номенклатура],
    Рег.КоличествоНачальныйОстаток as КолНачОст,
    Рег.КоличествоПриход as КолПриход,
    Рег.КоличествоРасход as КолРасход,
    Рег.КоличествоКонечныйОстаток as КолКонОст
FROM
    $РегистрОстаткиОбороты.ОстаткиТМЦ(:НачДата, :КонДата~,,,
    inner join $Справочник.Номенклатура as НомРег with (nolock) on НомРег.id = Номенклатура and НомРег.id in (select val from #СписокНом)                                                              
    inner join $Справочник.Склады as Склад with (nolock) on Склад.id = Скл and Склад.id in (select val from #СписокМагаз)                              
                               ,,(Номенклатура), (Количество)) as Рег

State 42000, native 102, message [Microsoft][ODBC SQL Server Driver][SQL Server]Неправильный синтаксис около конструкции ".".

(0) бред написан в соединениях унутри ВТ

Которые тебе
а) не нужны
б) неверно написаны.

По номенклатуре прокатывает. Добавляю склады - ошибка.

Ё...

FROM
    $РегистрОстаткиОбороты.ОстаткиТМЦ(:НачДата, :КонДата~,,,  ,(Номенклатура in (select val from #СписокНом)) and (Склад in (select val from #СписокМагаз)),(Номенклатура), (Количество)) as Рег


наслаждайся

Ну да, работает. Спасибо, наслаждаюсь.