Можно ли во внешнем отчете убрать пустые колонки, отчет Расчетная ведомость организаций, и если да, то где это сделать

Переделай во внешний и твори что хочешь с ним. А типовое уг не трогай - обновляя сам себе спасибо скажешь за это.

а где во внешнем найти, я чета с отладкой посидел сооброзить не могу (1) ладно ща еще раз прогоню

Колонки в отчёте - ресурсы. Поставь просто отбор в параметрах, СУММА <> 0, и усё - будут выводиться только не пустые колонки.